Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
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SEC23BQ15437 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
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SEC23BQ15437 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
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SEC23BQ15437 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
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SEC23BQ15437 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
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SEC23BQ15437 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
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SEC23BQ15437 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
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SEC23BQ15437 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
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SEC23BQ15437 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
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