Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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TRAM2Q15035 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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