Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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GTF2H3Q13889 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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GTF2H3Q13889 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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GTF2H3Q13889 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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GTF2H3Q13889 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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GTF2H3Q13889 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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GTF2H3Q13889 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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GTF2H3Q13889 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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GTF2H3Q13889 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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GTF2H3Q13889 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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