Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTGDRQ13258 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
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