Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SRSF6Q13247 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms