Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms