Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 SOX6-208ENST00000527619 2699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 CACNB4-254ENST00000637514 1880 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 LINC00652-201ENST00000412553 3299 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 AGO1-202ENST00000373206 3996 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 CNTNAP4-206ENST00000478060 3708 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 IFT74-204ENST00000443698 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 SLC26A7-202ENST00000309536 2656 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 NRCAM-201ENST00000351718 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 SALL4P7-201ENST00000555779 3120 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 SYCP1-202ENST00000369522 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 HMG20A-202ENST00000381714 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 BRCA1-201ENST00000352993 3668 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 IL1RAP-201ENST00000072516 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 FTH1P20-201ENST00000434913 548 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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