Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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