Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SCAPQ12770 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
SCAPQ12770 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
SCAPQ12770 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
SCAPQ12770 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SCAPQ12770 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SCAPQ12770 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SCAPQ12770 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SCAPQ12770 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SCAPQ12770 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SCAPQ12770 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SCAPQ12770 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SCAPQ12770 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SCAPQ12770 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SCAPQ12770 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SCAPQ12770 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SCAPQ12770 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SCAPQ12770 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SCAPQ12770 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SCAPQ12770 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SCAPQ12770 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SCAPQ12770 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SCAPQ12770 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SCAPQ12770 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SCAPQ12770 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SCAPQ12770 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SCAPQ12770 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SCAPQ12770 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SCAPQ12770 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SCAPQ12770 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SCAPQ12770 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SCAPQ12770 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SCAPQ12770 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SCAPQ12770 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SCAPQ12770 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SCAPQ12770 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SCAPQ12770 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SCAPQ12770 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SCAPQ12770 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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