Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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PTPRBP23467 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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PTPRBP23467 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
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