Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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