Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COL24A1Q17RW2 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.6 ms