Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PCK2Q16822 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PCK2Q16822 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PCK2Q16822 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PCK2Q16822 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PCK2Q16822 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PCK2Q16822 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PCK2Q16822 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PCK2Q16822 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PCK2Q16822 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PCK2Q16822 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PCK2Q16822 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PCK2Q16822 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PCK2Q16822 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PCK2Q16822 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PCK2Q16822 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PCK2Q16822 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PCK2Q16822 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PCK2Q16822 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PCK2Q16822 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PCK2Q16822 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PCK2Q16822 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PCK2Q16822 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PCK2Q16822 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PCK2Q16822 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PCK2Q16822 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PCK2Q16822 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PCK2Q16822 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PCK2Q16822 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PCK2Q16822 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PCK2Q16822 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms