Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
CDK13Q14004 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.9 ms