Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 LINC00652-201ENST00000412553 3299 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 TMEFF2-203ENST00000409056 3364 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 AL671511.1-201ENST00000425033 3458 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 KAT6A-201ENST00000265713 9153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 LRP2BP-203ENST00000510776 3055 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 ATP2B4-204ENST00000367218 8918 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 LINC01772-201ENST00000457898 3245 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 AXDND1-214ENST00000617277 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 CLEC5A-206ENST00000546910 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 RNA5SP152-201ENST00000365184 110 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 RNA5SP176-201ENST00000390956 110 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 NUCB1-AS1-201ENST00000416432 433 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 AC010605.1-201ENST00000597303 797 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 RGS7-201ENST00000348120 1980 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 UTY-202ENST00000331397 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 ZNF521-214ENST00000584787 4327 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 APOOL-203ENST00000622540 6466 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 LRRC37A12P-201ENST00000454917 1801 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 HEPH-209ENST00000519389 6013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 ZNF605-202ENST00000360187 9340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 KIDINS220-206ENST00000473731 7248 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 AC008560.1-201ENST00000510585 1766 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 B3GNT2-202ENST00000405767 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
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MKRN4PQ13434 SF3B3-201ENST00000302516 9720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
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MKRN4PQ13434 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
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MKRN4PQ13434 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
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MKRN4PQ13434 PDE8B-208ENST00000505283 3474 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 KIAA0391-203ENST00000534898 2611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 USPL1-203ENST00000614860 4074 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
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MKRN4PQ13434 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 CNOT4-206ENST00000428680 4642 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 POC1B-AS1-201ENST00000605233 8041 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 RNASE9-209ENST00000557068 2703 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 SYNE1-213ENST00000448038 6001 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
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MKRN4PQ13434 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 AC009948.1-203ENST00000450044 793 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 KC877392.1-201ENST00000524855 426 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 FHL1-227ENST00000628568 2304 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 ZNF841-201ENST00000389534 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 BMS1-201ENST00000374518 7753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN4PQ13434 SLC3A1-206ENST00000409740 1418 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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