Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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IFT88Q13099 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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IFT88Q13099 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
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IFT88Q13099 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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IFT88Q13099 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
IFT88Q13099 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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