Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRMP28827 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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