Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HOXD10P28358 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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