Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD8P13378 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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