Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
LRRTM2O43300 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
LRRTM2O43300 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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