Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KRTAP21-3Q3LHN1 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.5 ms