Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
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