Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
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