Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SS18Q15532 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SS18Q15532 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms