Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SHPRHQ149N8 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHPRHQ149N8 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms