Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.6 ms