Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
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