Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 GLRXP3-201ENST00000470810 321 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 SCARNA6-201ENST00000515982 265 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 AC010287.1-201ENST00000566916 357 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 RAI14-208ENST00000506376 3091 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 GAS1RR-201ENST00000415801 4387 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 SPECC1L-207ENST00000541492 3525 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 LRMP-204ENST00000547044 2208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 AC244100.2-202ENST00000612584 3878 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 ABCA9-201ENST00000340001 6514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 DYRK1A-201ENST00000338785 5498 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 UTY-213ENST00000612274 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 AL391811.1-201ENST00000416908 423 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 LIX1L-AS1-203ENST00000421764 287 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 TRBV29OR9-2-201ENST00000427589 333 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 AC027801.3-201ENST00000515049 698 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 AC011476.3-203ENST00000586961 346 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
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MKRN4PQ13434 MED6-212ENST00000615788 1700 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 AC114401.1-201ENST00000484222 2084 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 ARFGEF3-201ENST00000251691 14877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 SPATA31A1-201ENST00000377647 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 SPATA31A7-206ENST00000619167 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 CCP110-202ENST00000396208 5151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 STK4-202ENST00000372806 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 TP63-207ENST00000418709 2810 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 PRND-201ENST00000305817 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 ZC3H8-202ENST00000409573 5965 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
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MKRN4PQ13434 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 EPHA3-203ENST00000494014 3085 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 STAG1-202ENST00000383202 6055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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MKRN4PQ13434 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
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MKRN4PQ13434 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 AC015818.3-202ENST00000579603 283 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
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MKRN4PQ13434 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
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MKRN4PQ13434 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
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MKRN4PQ13434 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 TTC21A-203ENST00000431162 4209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 WDR89-202ENST00000394942 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 KIAA1210-201ENST00000402510 7824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 TEAD1-201ENST00000334310 3075 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 MAPK10-365ENST00000641902 3825 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
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