Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRSQ13332 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
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PTPRSQ13332 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
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PTPRSQ13332 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
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PTPRSQ13332 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRSQ13332 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
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PTPRSQ13332 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
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PTPRSQ13332 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
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PTPRSQ13332 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRSQ13332 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRSQ13332 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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