Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 AC016573.1-201ENST00000523205 539 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC2.46□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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