Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXA2O43364 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXA2O43364 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXA2O43364 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXA2O43364 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXA2O43364 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXA2O43364 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXA2O43364 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXA2O43364 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXA2O43364 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXA2O43364 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXA2O43364 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXA2O43364 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXA2O43364 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXA2O43364 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXA2O43364 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXA2O43364 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXA2O43364 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXA2O43364 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXA2O43364 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA2O43364 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA2O43364 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA2O43364 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA2O43364 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA2O43364 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA2O43364 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA2O43364 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA2O43364 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA2O43364 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA2O43364 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA2O43364 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA2O43364 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA2O43364 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA2O43364 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA2O43364 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA2O43364 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA2O43364 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA2O43364 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA2O43364 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA2O43364 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA2O43364 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXA2O43364 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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HOXA2O43364 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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HOXA2O43364 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
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HOXA2O43364 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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HOXA2O43364 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXA2O43364 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXA2O43364 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXA2O43364 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXA2O43364 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXA2O43364 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXA2O43364 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
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