Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SEMA3EO15041 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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