Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
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PTPRNQ16849 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
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PTPRNQ16849 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
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PTPRNQ16849 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
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PTPRNQ16849 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
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PTPRNQ16849 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
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PTPRNQ16849 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
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PTPRNQ16849 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
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PTPRNQ16849 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
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PTPRNQ16849 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
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PTPRNQ16849 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
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