Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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