Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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SGCBQ16585 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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SGCBQ16585 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
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SGCBQ16585 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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SGCBQ16585 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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SGCBQ16585 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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SGCBQ16585 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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SGCBQ16585 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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SGCBQ16585 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SGCBQ16585 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
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