Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms