Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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