Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
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