Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 SSX8-201ENST00000506270 579 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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FOXC1Q12948 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 PFKM-232ENST00000629846 381 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXC1Q12948 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 TRIM5-202ENST00000380034 2991 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 AC019197.1-202ENST00000414885 2639 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
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FOXC1Q12948 GARNL3-205ENST00000435213 3599 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
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FOXC1Q12948 TDRD1-201ENST00000251864 4510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 AMBN-203ENST00000613447 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 OR2T2-203ENST00000642130 3331 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 KCNIP4-202ENST00000382148 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 OR2T35-202ENST00000641268 2957 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 TRPM3-212ENST00000396283 3484 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 LMO3-208ENST00000441439 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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FOXC1Q12948 HSD17B13-201ENST00000302219 2269 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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FOXC1Q12948 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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FOXC1Q12948 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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FOXC1Q12948 AL359396.1-201ENST00000623151 2376 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 KLRD1-201ENST00000336164 3258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 TRIM49-201ENST00000329758 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 TRIM49C-201ENST00000448984 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 TRIM49B-202ENST00000622138 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 AP003119.3-201ENST00000566747 4192 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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