Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
BPTFQ12830 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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