Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms