Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 AC063943.2-201ENST00000495697 534 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
C4orf17Q53FE4 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 ARHGAP21-201ENST00000320481 4343 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 LINC01087-201ENST00000431979 3516 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 ZNF711-202ENST00000360700 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
C4orf17Q53FE4 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms