Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 TNPO1-204ENST00000506351 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 MT1A-201ENST00000290705 396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 AL031846.1-201ENST00000560933 314 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 PDE11A-212ENST00000358450 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 TRIM6-201ENST00000278302 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 NEDD9-208ENST00000504387 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 TYW1B-203ENST00000620995 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 EPB41L2-228ENST00000531410 2926 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 FBXW10-202ENST00000308799 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 ZC3H8-202ENST00000409573 5965 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 CBFA2T2-209ENST00000492345 7803 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 ZNF793-207ENST00000587986 3869 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 RN7SKP55-201ENST00000364888 307 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 MIR99A-201ENST00000384906 81 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 MIR152-201ENST00000385212 87 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 RNA5SP280-201ENST00000411230 115 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 AL591122.1-201ENST00000487348 492 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 CARSP2-201ENST00000520688 277 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 OR5M6P-201ENST00000530227 937 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 KIAA1324L-203ENST00000416314 3179 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 RTL3-201ENST00000321110 2648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 LCA5-201ENST00000369846 4542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 SHPRH-203ENST00000367505 7201 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 AP2B1-217ENST00000618940 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 DDX42-203ENST00000457800 3323 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 ERBIN-205ENST00000416865 2351 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 IYD-202ENST00000344419 8742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 AL117339.5-201ENST00000640275 3955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 ARNT-201ENST00000354396 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 UBN1-208ENST00000590769 3530 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 RIPOR2-208ENST00000613507 5539 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 MROH9-201ENST00000367758 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 AL845321.1-201ENST00000444603 348 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 RN7SL160P-201ENST00000468558 284 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 GRIK1-202ENST00000389124 2712 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 LINC00536-201ENST00000505156 2692 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 CD46-204ENST00000357714 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 LRRC37B-220ENST00000584368 2773 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 ZNF451-204ENST00000370708 9478 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 UEVLD-205ENST00000396197 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 B3GALT1-201ENST00000392690 5094 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 LINC01559-201ENST00000318426 2750 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 RNA5SP53-201ENST00000391299 120 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 RNU1-56P-201ENST00000391303 164 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 GOT2P2-201ENST00000450663 1251 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 RN7SL868P-201ENST00000485915 303 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 MIR6849-201ENST00000618543 69 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 KAT7-201ENST00000259021 9644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 NAPEPLD-209ENST00000465647 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 COL24A1-201ENST00000370571 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 EPHA4-201ENST00000281821 6346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 FRY-207ENST00000542859 13200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 AC002384.1-203ENST00000602761 3049 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 ZNF225-201ENST00000262894 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms