Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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