Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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RAB39AQ14964 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
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RAB39AQ14964 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
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RAB39AQ14964 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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RAB39AQ14964 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
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RAB39AQ14964 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
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RAB39AQ14964 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RAB39AQ14964 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
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