Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
FHL3Q13643 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
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