Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATRQ13535 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATRQ13535 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
ATRQ13535 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATRQ13535 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATRQ13535 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ATRQ13535 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ATRQ13535 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATRQ13535 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ATRQ13535 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATRQ13535 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
ATRQ13535 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
ATRQ13535 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
ATRQ13535 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
ATRQ13535 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
ATRQ13535 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ATRQ13535 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ATRQ13535 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATRQ13535 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATRQ13535 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ATRQ13535 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATRQ13535 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ATRQ13535 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATRQ13535 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATRQ13535 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ATRQ13535 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
ATRQ13535 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATRQ13535 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATRQ13535 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ATRQ13535 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATRQ13535 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
ATRQ13535 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
ATRQ13535 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
ATRQ13535 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ATRQ13535 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
ATRQ13535 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ATRQ13535 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ATRQ13535 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ATRQ13535 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
ATRQ13535 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATRQ13535 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATRQ13535 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
ATRQ13535 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATRQ13535 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATRQ13535 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATRQ13535 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATRQ13535 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ATRQ13535 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATRQ13535 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
ATRQ13535 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ATRQ13535 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
ATRQ13535 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ATRQ13535 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATRQ13535 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ATRQ13535 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATRQ13535 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ATRQ13535 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATRQ13535 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
ATRQ13535 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
ATRQ13535 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
ATRQ13535 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
ATRQ13535 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
ATRQ13535 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ATRQ13535 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ATRQ13535 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATRQ13535 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATRQ13535 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ATRQ13535 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
ATRQ13535 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ATRQ13535 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATRQ13535 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ATRQ13535 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ATRQ13535 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ATRQ13535 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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