Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TPRNQ4KMQ1 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.8 ms