Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
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GEN1Q17RS7 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GEN1Q17RS7 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
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