Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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